当量子危机的余波尚未散尽，宇宙深空突然浮现出无数蠕动的琥珀色晶体，时空医莲的花蕊渗出腥臭的黑血，在虚空中勾勒出诡异的基因链图案。秦逸与林婉的星辰意识被一股带着腐朽气息的波动侵袭，锈蚀银针表面的“量子纹”泛起诡异的锈斑，纹路间渗出的能量如同变异的病毒，所到之处，所有文明的生命基因开始扭曲——机械文明的仿生医师金属骨架长出血肉脓包，魔法大陆的精灵祭司肢体分裂成畸形触须，修真者丹田内的金丹被侵蚀成蠕动的肉瘤。
“这是跨文明的基因污染！”林婉的金瞳蒙上一层浑浊的薄膜，映出星图上如癌细胞扩散的琥珀色脉络，“有人在改写生命最本源的代码，医道连救治的根基都将不复存在！”秦逸的神农血脉沸腾如岩浆，他看到机械文明的医疗舱将健康细胞判定为变异体进行清除，魔法大陆的治愈泉水反而加速了基因畸变，修真者的疗伤功法成了催化异变的毒药。
星孩悬浮在污染核心的基因茧中，婴儿的身体被螺旋状的变异基因链缠绕，皮肤下透出不断重组的畸形染色体。他无意识的呜咽化作刺耳的基因重组指令，每一声都让时空医莲的根茎扭曲成dNA双螺旋结构，太素本源在基因污染的侵蚀下泛起腐臭的暗斑。“这些污染波动...和锈蚀银针产生了共鸣！”林婉的金瞳光芒凝成净化光束，却在触及茧房的瞬间被异变成腐蚀射线。
在琥珀色脉络深处，一座由破碎的基因图谱与扭曲的进化树构成的巢穴缓缓升起。巢穴中央，初代道侣残存的意识与基因污染能量融合，形成一个浑身布满变异组织的“基因畸变者”。她的身体由不同文明扭曲的生物特征拼凑而成，面孔在人类、机械、精灵等形态间痛苦切换，声音混杂着生物的嘶吼与代码的报错声：“秦逸，林婉，当生命基因失去意义，医道不过是在救治怪物！”随着话音落下，巢穴四周的基因链化作吞噬生机的触手，将两人卷入变异的深渊。
锈蚀银针突然分裂成无数“基因碎片”，每一片都携带不同文明的致命突变。秦逸握紧主针，试图用神农血脉修复基因序列，却发现针身反而加速了污染进程。林婉的金瞳光芒凝成基因剪刀，可剪刀在接触变异基因时被同化，变成助长畸变的工具。
“对抗基因污染需要回归生命最原始的形态！”秦逸的意识在剧痛中捕捉到星孩体内若隐若现的归墟微光——那是万物诞生前的纯净本源。两人强行凝聚残存的力量，将神农血脉、金瞳光芒与归墟能量融合，形成能溯源净化的“太素基因熔炉”。同时，他们调动所有被治愈者对生命本真的记忆、对纯净基因的渴望，将这些精神力量注入熔炉。
当熔炉的光芒笼罩巢穴，基因畸变者发出震碎空间的惨叫，巢穴开始崩塌，但基因污染能量却在此时汇聚成能吞噬所有生命的“畸变黑洞”。千钧一发之际，星孩的意识突然苏醒，归墟能量化作包容一切的原始生命汤，将肆虐的基因污染尽数中和。秦逸和林婉趁机将太素基因熔炉的力量注入黑洞核心，在超越进化的光芒中，基因畸变者逐渐消散，初代道侣的意识露出解脱的神情：“原来...生命的纯粹...才是永恒的答案...”
危机解除后，琥珀色脉络化作漫萤火，锈蚀银针表面的“量子纹”与基因污染能量融合，形成流转着神秘光芒的“溯源纹”。秦逸与林婉的意识回到星辰之中，看着逐渐恢复生机的宇宙，深知基因污染的威胁仍潜藏在生命的暗处。星孩重新安静沉睡，时空医莲的光芒带上了净化与重生的力量，而在宇宙的某个角落，新的变异因子正在悄然滋生，等待着再次挑战生命的本源。
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