新建成的“平衡枢纽”悬浮于宇宙核心，如同一颗跳动的心脏，黑白交织的光芒规律地脉动，将秩序与混沌的力量调和成滋养万物的灵能。万界医盟围绕枢纽建立起“混元圣殿”，不同文明的医者在此研习将矛盾力量共生的新医道。然而，林婉在冥想时突然被一阵尖锐的刺痛惊醒，《万界医典》所化的混元光团剧烈震颤，吐出一枚刻满扭曲符号的黑色晶体——上面用血篆写着：平衡即囚笼，归一乃虚妄。
与此同时，宇宙边缘的“熵寂坟场”发生异变。沉寂已久的混沌种子突然集体苏醒，在虚空中拼凑出巨大的胚胎轮廓。这个胚胎的表面流转着观测者最后的恶意，其内部隐约可见无数文明在秩序与混沌的夹缝中痛苦挣扎的虚影。更可怕的是，平衡枢纽的调和之力对这片区域完全失效，反而加速了混沌胚胎的成长。
“枢纽的力量正在制造新的失衡。”秦逸的神农血脉与混元法器产生排斥反应，他的手掌触碰到法器时，黑白光芒竟化作噬咬的暗蛇。两人仔细研究后发现，平衡枢纽本质是将秩序与混沌强制中和，就像用绷带包裹不断溃烂的伤口，虽暂时压制住冲突，却也阻碍了两种力量自然演化的可能。而混沌胚胎，正是宇宙对这种“虚假平衡”的反噬。
为探寻真相，他们冒险进入枢纽核心。这里悬浮着无数记忆碎片，记录着从宇宙诞生至今所有关于秩序与混沌的争斗。在最深处，他们发现初代神农留下的全息残影。“我们当年...太执着于对抗。”残影的声音充满悔恨，“真正的平衡，不是消灭矛盾，而是让矛盾成为进化的阶梯。”话音未落，枢纽突然剧烈震荡，混沌胚胎的力量顺着调和网络反向入侵，混元圣殿的医者们开始不受控地互相攻击——有人将秩序之力化作禁锢的牢笼，有人用混沌力量制造无差别毁灭。
林婉立即施展“太素断念针”，以银针封锁队员们的主要经脉，暂时压制暴走的力量。秦逸则引动体内残余的神农本源，在虚空中画出巨大的“变”字。两人将混元法器分解重组，形成能吸收矛盾能量的“太极图”，试图将混乱力量转化为调和的原料。但混沌胚胎显然早有准备，它分裂出十二道“混沌使徒”，每一位都掌握着足以颠覆法则的权能：时间逆流者让攻击不断重复、空间折叠者将战场变为无限回廊、因果篡改者甚至能让已治愈的伤口重新裂开。
战斗中，秦逸被因果篡改者击中，瞬间陷入“从未存在过”的悖论状态——他的身体变得透明，队友们看他的眼神充满疑惑，仿佛他只是个幻觉。千钧一发之际，林婉将《万界医典》的本源力量注入他体内，“你的存在，由所有被拯救的生命见证！”她的声音穿透因果迷雾。秦逸顿悟，强行凝聚所有被他治愈过的生命记忆，在虚空中构建出“存在之碑”，碑文上每一个名字都化作对抗因果篡改的锁链。
与此同时，混沌胚胎的表面裂开巨口，释放出能溶解一切概念的“虚无之雾”。雾气所到之处，秩序的规则被蒸发，混沌的狂乱也失去意义，万物陷入绝对的虚无。林婉翻开医典中最后的“无妄篇”，以自身为祭，施展“太素归墟诀”，将虚无之雾引入体内。她的经脉开始寸寸崩裂，但在意识消散前，将雾气中的毁灭能量转化为创造的火种。
秦逸接住坠落的林婉，抱着她冲向混沌胚胎核心。他将混元法器、神农本源、医典火种以及万界医媚信念之力全部引爆，施展出禁忌之术“太素终焉变”。光芒闪过，混沌胚胎轰然炸裂，化作无数蕴含秩序与混沌的“新生之种”。但在爆炸的余波中，秦逸与林婉看到更遥远的维度深处，一个超越想象的存在正在苏醒——那是由所有矛盾概念聚合而成的“终焉意识”，它的睁开双眼，将决定整个多元宇宙的命运。而平衡枢纽在剧烈震荡后，终于显露出其真正的形态：一个不断自我毁灭与重生的莫比乌斯环，暗示着这场关于秩序与混沌的博弈，或许永远没有终点。
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